Hola a tod@s
El problema que tengo es el siguiente:
Tengo 2 listas de genes significativos resultantes de aplicar un t test de entre una condicion Control y un Tratamiento con un farmaco en 4341 genes.
lista 1: Farmaco 1 vs Control = 171 genes diferenciales
lista 2: Farmaco 2 vs Control = 1180 genes diferenciales
Numero total de genes sobre los que se aplico el test = 4341
Resulta que ambos farmacos pueden tener efectos parecidos sobre los controles. Al cruzar ambas listas en un diagrama de Venn lo que se observa es lo siguiente:
Exclusivos de Farmaco 1 vs Control = 73
Comunes a Farmaco1 vs Control y Farmaco 2 vs Control = 98
Exclusivos de Farmaco 2 vs Control = 1082
Universo = 4341 genes
Mi pregunta es:
Para averiguar si existe un enriquecimiento significativo de genes comunes de lo que se esperaria al azar serviría con aplicar un Test de la Chi cuadrado en SPSS?
SI este test no es correcto que prueba estadística recomendais?
Muchas gracias por adelantado
Dietmar
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