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clado · Cladística
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ILD como criterio de meta-optimalidad   Lista de mensajes  
Responder | Reenviar Mensaje #112 de 1056 |
Re: [clado] ILD como criterio de meta-optimalidad


Hola

Sobre el caso que plantea Martín en el cual agregando
caracteres informativos pasa lo mismo que agregando no
informativos. Si la cuestion no esta dada por
la”informatividad” de los caracteres, podría ser un
artefacto generado durante el remuestreo con el cual
se construye el test estadístico? causado por la
diferencia de tamaños entre las matrices y la
frecuencia en que aparecen los caracteres inf.
agregados a estas?. Seria lo mismo que pasa con los no
informativos, al generar las matrices al azar estos
caracteres agregados tenderían a homogeneizar las
matrices con lo cual los ILD van a tender a ser mas
bajos que el original y el P. significativo??

Con especto a la relatividad de la “informatividad” de
los caracteres. No me queda claro como seria la
gradación de la “informatividad” de los car.
informat.. Estaría relacionada con la
exclusividad/inclusividad de los grupos que une cada
carácter?.


Que opinan del paper de Dolphin et al., acerca de la
influencia del ruido (y su repartición en las matrices
a comparar) en la significancia del ILD. En este
trabajo hacen referencia explicita al Test de Mann
Whitney (seria el equivalente) y según estos tipos
este debería testear la diferencia entre las media
(señal filogenetica) de dos muestras y no estar
influido por la diferencia de las varianzas (ruido).
Ahora, este test estadístico es No Paramétrico, ¿no???


Pancho
--- Martin Ramirez <ramirez@...> wrote:
> Otro de los temas que discutimos tiene relación con
> el trabajo de Lone
> (posteado como Aagesen et al 2005.pdf).
>
> Parece que Dowton & Austin (2001) hacen simulaciones
> de distintos
> fragmentos, y luego se fijan qué esquemas de costos
> tv/tr minimizan la
> incongruencia según el el ILD (escalado, WILD). Los
> costos que obtienen no
> tienen nada que ver con los costos con los cuales
> las simulaciones feron
> hechas.
>
> Esto suena a que el método no funcionaría para
> simulaciones--ni hablar de
> datos reales. Lone presenta algunas correcciones
> del ILD, me pregunto si
> en ese caso darían resultados más o menos
> coherentes?
>
> Martín
>
> ------
> Aagesen, L., G. Petersen & O. Seberg. 2005.
> Sequence length variation,
> indel costs, and congruence in sensitivity analysis.
> Cladistics 21: 15-30.
>
>
>
> Martín J. Ramírez
> División Aracnología
> Museo Argentino de Ciencias Naturales
> Av. Angel Gallardo 470
> C1405DJR Buenos Aires
> Argentina
> tel +54 11 4982-8370 int. 168
> fax +54 11 4982-4494
>
>

Francisco Juan Prevosti
Departamento Científico
Paleontología Vetebrados,
Museo de La Plata,
Paseo del Bosque S/Nº,
1900 La Plata,
Buenos Aires - Argentina



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Vie, 15 de Abr, 2005 2:27 pm

protocyon
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Reenviar Mensaje #112 de 1056 |
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Otro de los temas que discutimos tiene relación con el trabajo de Lone (posteado como Aagesen et al 2005.pdf). Parece que Dowton & Austin (2001) hacen...
Martin Ramirez
martin_8p
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15 de Abr, 2005
2:11 pm

Hola Sobre el caso que plantea Martín en el cual agregando caracteres informativos pasa lo mismo que agregando no informativos. Si la cuestion no esta dada...
Francisco prevosti
protocyon
Sin conexión Enviar correo
15 de Abr, 2005
2:27 pm

(de Lone, a su servidor no le gusta el yahoo) Bueno, ya me veo obligada a responder: Las medidas de congruencia fueron desarrolladas dentro de un contexto de ...
Martin Ramirez
martin_8p
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15 de Abr, 2005
3:24 pm

Hola Pancho, (usemos subjects que nos permitan seguir las líneas de discusión ordenadas) Creo que la 'informatividad' tiene que estar asociada a grupos o...
Martin Ramirez
martin_8p
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15 de Abr, 2005
8:21 pm

ok. gracias por la explicacion!!! PAncho ... Francisco Juan Prevosti Departamento Científico Paleontología Vetebrados, Museo de La Plata, Paseo del Bosque...
Francisco prevosti
protocyon
Sin conexión Enviar correo
15 de Abr, 2005
8:27 pm

Bueno, ya me veo obligada a responder: Las medidas de congruencia fueron desarrolladas dentro de un contexto de 'equal weighting' - no?, y párese que traen...
Lone Aagesen
laagesen@...
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15 de Abr, 2005
3:28 pm
Avanzado

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