Estimados,

> Sería un jackknifing de taxones? No sé si algún programa lo tiene
> implementado...

si mal no recuerdo esto es precisamente el jacknifing originalmente
propuesto por Lanyon (1985). Siddall publicó un paper sobre esto, creo
que a fines de los 90 (se me fue la fecha exacta). El lo implementó en su
paquete "Random Cladistics", del que supongo que todavía pueden
encontrarse copias en la web. Llama a Hennig86 o NONA como
sub-procesos...

> creo que Pablo tiene un macro para tnt. Si no, no sería muy
> complicado hacerlo.

el macro que yo hice mide la estabilidad general ante remoción de taxones,
no de grupos en particular. Y además, funciona en paralelo bajo Linux.

Para medir esto sería más fácil hacer un macro desde cero. Lo más fácil
es analizar los datos completos, guardar el consenso en un archivo
temporario, y luego hacer un loop, que vaya eliminando los taxones y
analizando cada vez. Cada vez que eliminas un(os) taxon(es), hacés el
supertree (comando mixtrees) del consenso original (completo) y del
reducido, y para cada grupo del consenso original llevás registro de en
cuántas réplicas aparece.

Espero que esto sirva como orientación. Tiene el problema que no puede
interpretarse del mismo modo que se interpreta un jacknifing de
caracteres, que me indica cantidades relativas de evidencia a favor y en
contra de un grupo. La frecuencia de aparición (o de compatibilidad, en
el método que propuse en el párrafo anterior) de un grupo al eliminar
taxones no tiene una interpretación directa, excepto como una estimación
(muy tosca) de cuánto podríamos esperar que cambien los resultados si
agregamos taxones.

Saludos,

--Pablo Goloboff