FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES - ESCUELA DE POSGRADO DOCTORADO EN CIENCIAS BIOLOGICAS

CURSO DE POSGRADO: "BIOINFORMATICA"

Carga Horaria: 60 horas

Distribución horaria: 09:00 a 13:00 y 15:00 a 19:00 hs.

Fecha: 28 de agosto al 1 de setiembre de 2006

Lugar: Microcine y Sala de Cómputos de Cómputos de la Facultad de Ciencias Naturales - Edificio de Agronomía - Planta Baja.

Destinatarios: Alumnos de la Carrera del Doctorado en Ciencias Biológicas. Profesionales interesados en la temática del Curso. Alumnos de grado que estén cursando el último año.

Condiciones de ingreso: Es condición para realizar el curso estar inscripto en la Carrera de Doctorado en Ciencias Biológicas. Se aceptarán egresados no inscriptos en la Carrera de Doctorado y alumnos de ultimo año para las clases Teóricas y mostraciones.

Condiciones de aprobación: Trabajo escrito en el cual se presentará el análisis y utilización de un programa de bioinformática con formato de manual. Se pretende acceder a los fundamentos sobre los cuales se basan los programas de bioinformática de uso más común. De este modo se pretende mejorar el aprovechamiento de las herramientas bioinformáticas disponibles, por parte estudiantes del Doctorado, en el desarrollo de su Tesis Doctoral.

Certificados: *Asistencia y/o aprobación.*

* **ARANCEL*: $ 150 El pago debe realizarse en la Dirección Administrativa Económica de la Facultad de Ciencias Naturales, lunes a viernes de 8 a 14 hs.

A los alumnos del Doctorado en Ciencias Biológicas que realicen este curso se les otorga una beca de $50, por lo que el arancel que deben pagar es de $100.

CUPO: 26 participantes.

*INFORMES E INSCRIPCIÓN**: **Personalmente en: *

ESCUELA DE POSGRADO

FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES

UNIVERSIDAD NACIONAL DE SALTA

*Avda. Bolivia 5150 _ 4400 _ Salta

*Por e-mail: malena@...

*PROGRAMA SINTETICO: *

***1. Introducción*. Conceptos de algoritmo y programa. Grados de complejidad. Conceptos de información. Validación estadística. Máxima verosimilitud. Probabilidad /a posteriori/.

*2. Bases de datos.* Organización de la información de bases de datos de interés biológico. Bases de datos de secuencias de ácidos nucléicos y proteínas. Bases de datos generales (primarias) y específicas.

Organización de la bases de datos del "National Center for Biotechnology Information".

_TP 1 (nivelación):_ Bases de datos, organización.

*3. Alineamientos de secuencias.* Alineamiento de dos secuencias.

Programación dinámica. Alineamientos globales y locales. Blast. Matrices de sustitución. Alineamientos múltiples.

_TP 2:_ Bases de datos de secuencias. Recuperación de secuencias.

Tutorial Blast, Psi-Blast. Alinemientos múltiples mediante Clustal W.

Edición de alineamientos múltiples.

*4. Perfiles, motivos y consensos.*. Expresiones regulares. Matrices de probabilidad sitio específica. Perfiles mediante Hiden Marcov Models.

Alineamientos contra perfiles HMM. Cantidad de información en motivos, Logos. Aplicaciones, búsqueda en base de datos.

_TP 3:_ Construcción de consensos, MEME/MAST, HMMER. Bases de datos de perfiles, motivos y consensos.

*5. Análisis genómico.* Secuenciamiento genómico. Calidad de secuencias.

Ensamblado de secuencias genómicas. Determinación de secuencias codificantes. Asignación de genes. Clusterización. Grupos de ortólogos (COGs). Ontología Génica (GO). Bases de datos genómicas. Comparación de genomas. Integración de bases de datos.

*6. Microarrays.* Tipos de microarrays, de productos de PCR inmobilizados y de oligonucleótidos inmoblizados. Análisis de datos de hibridaciones de Microrrays. Análisis Exploratorio: Clusterización y métodos de Projeccion. Métodos de clasificación.

_TP 4 (mostracion):_ Herramientas disponibles en la web para el anlasis de Microarrays.

*7. Análisis filogenético.* Conceptos de evolución. Relojes moleculares.

Clasificación filogenética. Arbol de la vida. Métodos de reconstrucción filogenética. Métodos de parsimonia. Métodos de distancia. Métodos de máxima verosimilitud. Métodos bayesianos. Programas disponibles.

_TP 5:_ Métodos de reconstrucción filogenética. Métodos de parsimonia.

Métodos de distancia. Métodos de máxima verosimilitud. Métodos bayesianos. Programas disponibles.

María Elena Rodrigo

Directora Adm. Escuela de Posgrado

Facultad de Ciencias Naturales

Universidad Nacional de Salta