Hola a todos,

Estoy analizando una matriz de datos combinados de 235
spp. Morfología, varias secuencias (16S, 12S, cytb,
ND2). Sin embargo, para algunas de estas secuencias
hay una gran cantidad de taxones que presenta datos
ausentes ("?").

Tengo varias problemas con esto. Creo que algunos
agrupamientos están mal. Quisiera hacer una análisis
particionado para ver la congruencia entre la
morfología, y las diferentes secuencias. Pero ya que
hay una gran cantidad de missing data en la matriz que
creo que esto puede generar problemas. Por ejemplo,
para el 16S solo hay 21 spp. con datos de un total de
235, y algo parecido para 12S, cytb. ND2 esta mas
completo (182 spp.).

No se que tan conveniente sea excluir esos subsets de
datos incompletos. J. Wiens ha escrito algunas cosas
sobre esto y menciona que deben dejarse, pero sus
análisis suelen funcionar para set de datos pequeños,
con pocas especies. Será posible que el análisis
combinado (i.e, evidencia total) bajo esta situación
de missing data no resulte tan efectivo?


Julian

Julián Andrés Velasco

Grupo de Investigacion en Ecología Animal Aplicada
Departamento de Biologia
Universidad del Valle
Cali-Colombia
juvelas@...





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