Hola Gabriel
Yo estuve explorando el tema hace poco para mi proyecto de grado ;)...
Te recomiendo leer primero el paper de Pablo Goloboff del 97 de self weight ;) allí el propone hacer una matriz remuestreada (jackknife) y comparar los resultados con los de la matriz completa. En esa ocasión, Pablo uso el número total de nodos soportados en ambos conjuntos de datos.
Martín Ramírez uso ese método explícitamente para seleccionar la constante de concavidad, aunque el prefirió utilizar el numero de nodos comunes escalado por la resolución tanto del árbol (de consenso) para la matriz completa, y como apoyo secundario, por el árbol de la matriz remuestreada. El paper de Martín es un bulletin del AMNH del 2003 reo y lo puede bajar gratis de la red :)
De mis exploraciones, las medidas escaladas están afectadas por el nivel de resolución, pues se prefieren funciones que produzcan árboles con poca resolución. Pablo en el meeting de la Hennig del año pasado mostró que las medidas escaladas pueden preferir funciones de pesado al azar!
Yo también explore una modificación del ILD, pero estas producen diferencias muuuy pequeñas entre las funciones.
Hay una cosa que hay que tener en cuenta, es que si los resultados son muy variables entre diferentes funciones, es mejor tratar de ser conservativos y escoger los clados soportados en un rango de valores de concavidad (Esta idea me la sugirió Pablo cuando yo estaba trabajando en mi trabajo de grado).
Si quieres, yo te puedo mandar el ms que hice para mi proyecto de grado (aunque aun anda algo crudo :P), y en mi blog puse un post sobre el asunto hace un buen tiempo (http://cladistica.blogspot.com/2006/01/seleccin-de-funciones-en-cladstica.html), aunque es casi lo mismo que esta escrito aquí ;).... es relativamente sencillo hacer un script para TNT que te muestre el numero de nodos compartidos, yo tengo algunos en la pagina de mi lab... pero no están muy bien documentados XP...
Como vez, el tema me obsesiona, jajajaja, y bueno, espero te sirvan algunas ideas :) y si necesitas biblio me avisas ;)
J. Salvador Arias
Laboratorio de sistemática y biogeografía
Escuela de biología
Universidad Industrial de Santander
A. A. 678 Bucaramanga, Colombia
web-site: http://ciencias.uis.edu.co/labsist/salvador/salvador.htm
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