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clado · Cladística
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RE: [clado] macro para pesado de caracteres

Ah, ok.  Solamente del nodo basal, o hay interés en las probabilidades para cada uno de los nodos del árbol?  Martin

PS: Sugerencias para archivos en la carpeta Bibliografía:
--Nombre del archivo con formato de cita estándar (por ejemplo, "Fulano et al 2001.pdf")
--Descripción con formato de referencia bibliográfica estándar (por ejemplo, "Wiens, J. J. 2004. The Role of Morphological Data in Phylogeny Reconstruction. Syst. Biol. 53(4):653-661.")


At 07:44 PM 11/12/2004, you wrote:
Optimizaciones
----- Original Message -----
From: Martin Ramirez
To: clado@...
Sent: Friday, November 12, 2004 7:40 PM
Subject: RE: [clado] macro para pesado de caracteres


No entendí qué se busca.  Optimizaciones?  Arboles?
martin


At 06:51 PM 11/12/2004, you wrote:
>Sobre consulta de Jman y respuesta de Martín:
>o sea sobre "el pesado de Hausdorf":
>
>Creo que se entendió mal. El macro que propone Martín no serviría pa' esto.
>Lo que propone este muchacho (Don Hausdorf) es así:
>
>optimización de fitch para cada unas de las áreas (por separado) y contando:
>a.  en el caso que el área NO esté en la raíz (entonces numero de veces
>que se gana)
>b. en el caso en que el área SI está en la raíz (entonces numero de veces
>que se pierde)
>Por tanto debemos pedirle al programa que fuerce los estados ancestrales.
>
>Luego pesar pa' cada caso con el numero de internodos que hay desde el
>ancestro (en realidad 1/N, n es el numero de internodos).
>Luego dividís lo que sacas en ganar por lo que sacas en perder y galerín:
>sale el PI! el probability index de que el área fuera parte del área ancestral.
>Se comparan todos los PI y te quedarías con el mejor...
>
>El muchacho está pensando en acctran y deltran... lo dice en pag. 447
>Creo que mas o menos es así la cosa. La fuente: Bernhard Hausdorf Syst.
>Biol. 47:445-456. 1998.
>
>Que tal un macro de esto Martín? je je!!
>
>>



 
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Martín J. Ramírez
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Sáb, 13 de Nov, 2004 3:08 pm

martin_8p
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Hola a todos: Aprovecho esta primera vez que escribo para saludarlos a todos, y pedir un poco de ayuda, en especial a aquellos que tengan conocimientos de...
jman_acunsa
Sin conexión Enviar correo
11 de Nov, 2004
1:11 pm

Hola Juan Manuel, Acabo de postear el macro: http://ar.groups.yahoo.com/group/clado/files/scripts/TNT/REWT.RUN Si tenés que implementar una función...
Martin Ramirez
martin_8p
Sin conexión Enviar correo
11 de Nov, 2004
4:15 pm

Sobre consulta de Jman y respuesta de Martín: o sea sobre "el pesado de Hausdorf": Creo que se entendió mal. El macro que propone Martín no serviría pa'...
Claudia Szumik
clauszu
Sin conexión Enviar correo
12 de Nov, 2004
9:56 pm

No entendí qué se busca. Optimizaciones? Arboles? martin...
Martin Ramirez
martin_8p
Sin conexión Enviar correo
12 de Nov, 2004
10:38 pm

Optimizaciones ... From: Martin Ramirez To: clado@... Sent: Friday, November 12, 2004 7:40 PM Subject: RE: [clado] macro para pesado de...
Claudia Szumik
clauszu
Sin conexión Enviar correo
12 de Nov, 2004
10:48 pm

Ah, ok. Solamente del nodo basal, o hay interés en las probabilidades para cada uno de los nodos del árbol? Martin PS: Sugerencias para archivos en la...
Martin Ramirez
martin_8p
Sin conexión Enviar correo
13 de Nov, 2004
3:07 pm

Hola Juan Manuel Yo no creo poder ayudarte ya que no se nada de programación. Es posible que si hablas con Pablo te diga si es facible o no hacerlo. Un abrazo...
"Sergio Roig-Juñent"
sergioroigju...
Sin conexión Enviar correo
12 de Nov, 2004
5:26 pm
Avanzado

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