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clado · Cladística
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nexus   Lista de mensajes  
Responder | Reenviar Mensaje #714 de 1046 |
Re: [clado] nexus

Hola Gabriel,

TNT no exporta las matrices de continuos, pero nexus tiene un formato de
continuos:

BEGIN CHARACTERS;
TITLE Measurements;
DIMENSIONS NCHAR=4;
FORMAT DATATYPE = CONTINUOUS;
CHARSTATELABELS
1 toe_length,
2 slime_index,
3 puncture_density,
4 sneakiness ;
MATRIX
Aus 0.1217 2.298 0.0 1.0
Fubonidia 0.111 1.9 1.0 1.0
Ibbinidibe 0.102 4.2 2.0 0.35
Snorolopa 0.112 3.7 3.0 0.0
Quidnubia 0.137 1.3 4.0 0.87
Suinon 0.145 2.9 5.0 0.05
Zorabynyx 0.139 2.7 6.0 0.2
Huichoros 0.108 3.5 7.0 0.0
Jotinupa 0.156 2.298 8.0 0.0

esto lo leen los programas sin problemas (Mesquite al menos), va como un
bloque separado de la matriz de caracteres comun (ADN y/o morf.).
No acepta intervalos, o sea que tendras que usar la media; y obviamente
Paupooh (lease "popó") no usa los continuos para las busquedas,
solamente los podes reconstruir (optimizar) en Mesquite, y hacer alguna
cosilla estadistica.
Comentales esto a los editores del yurnal, porque seguro que los
resultados de correr la matriz nexus son los mismos que si le sacaras
los continuos...

Saludos,

Camilo

Rua Gabriel Hugo escribió:
>
> Hola gente!
> ¿Alguien sabe si se puede (y, en caso afirmativo, cómo) exportar a
> formato 'nexus' una matriz de TNT que contiene caracteres continuos
> (me la piden los editores de un "yurnal")?
> Se agradece...
> GHR
>
>
>
>
> ________________________
> GABRIEL HUGO RUA
> Cátedra de Botánica Agrícola,
> Facultad de Agronomía,
> Universidad de Buenos Aires.
> Avenida San Martín 4453,
> C1417DSE Buenos Aires,
> ARGENTINA
> Tel: +54-11-4524 8000 int. 8173
> Email: ruagabri@... <mailto:ruagabri@...>
>
>

--
---------------------------------------------------
Camilo Mattoni
Catedra de Diversidad Animal I
Facultad de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales
Universidad Nacional de Cordoba
Av. Velez Sarsfield 299
5000 Cordoba
ARGENTINA
cmattoni@...
camilomattoni@...
Phone: (54) 351 433-2090 (int. 41)
---------------------------------------------------




Mar, 15 de Abr, 2008 12:07 pm

camilomattoni
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Hola gente! ¿Alguien sabe si se puede (y, en caso afirmativo, cómo) exportar a formato 'nexus' una matriz de TNT que contiene caracteres continuos (me la...
Rua Gabriel Hugo
elgabrielo2000
Sin conexión Enviar correo
14 de Abr, 2008
11:16 pm

Hola Gabriel, TNT no exporta las matrices de continuos, pero nexus tiene un formato de continuos: BEGIN CHARACTERS; TITLE Measurements; DIMENSIONS NCHAR=4; ...
Camilo Mattoni
camilomattoni
Sin conexión Enviar correo
15 de Abr, 2008
12:07 pm

Hola, mira yo creo quue el programa mesquite (que es gratis; http://mesquiteproject.org/mesquite/mesquite.html) puede leer matrices de TNT y exportarlas al...
alejandro valerio
zarcob13
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17 de Abr, 2008
3:15 am

Hola gente! Gracias a Camilo y a Alejandro por los comentarios sobre el formato nexus, etc. La matriz se dejó hacer todo sin protestar... GHR ...
Rua Gabriel Hugo
elgabrielo2000
Sin conexión Enviar correo
22 de Abr, 2008
7:38 pm
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