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clado · Cladística
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Responder | Reenviar Mensaje #841 de 1046 |
Hola, estoy corriendo una matriz de 290 x 1100 en Mr Bayes y no puedo llegar al punto optimo (0.01).
Despues de correr 10.000.000 de generaciones llegoa 0.05, el tema es que no se si estoy dandole una freq de muestreo muy chica (10) y por eso no llego o tal ves no esté entrando alguna variable importante. Los datos que le ingreso al programa son: La freq de bases, la freq de sustitucion, el gamma shape, lset, pinvar y hago una busqueda de 10.000.000 con una freq de muestreo de 10. Esto lleva aprox un tiempo de 4 días de corrida y hoy voy a probar con alguna cambio, pero si alguien tiene alguna sugerencia, son bienvenidas.
 
Saludos.
 
Samuel

--- El mié 25-mar-09, Marcos Mirande <mcmirande@...> escribió:

De: Marcos Mirande <mcmirande@...>
Asunto: [clado] Nuevos doctores en Tucumán!!
Para: clado@...
Fecha: miércoles, 25 de marzo de 2009, 9:33 pm

Hola a todos!!

Tengo el enorme agrado... y orgullo... casi... de anunciar las proximas defensas de tesis doctorales en la "tierra de las oportunidades" (no, era broma...aquí en Tucumán). Dos nuevos doctores cladistas están saliendo del horno.

Guillermo Suárez
Defensa: Viernes 27/03 a las 12 hs.

Tema: "La filogenia de Pohlia" (Musgos de montaña iguales a los musgos de llanura y a todos los restantes musgos)


Sebastián Barrionuevo
Defensa: Viernes 27/03 a las 16 hs.

Tema: "Filogenia de Telmatobius" (Ranas de montaña diferentes a las ranas de llanura y a todas las otras ranas pero iguales entre ellas)


FELICIDADES a ambos!!!

Marcos, en representació n de la Liga Cladista Tucumana


Saludos a todos!

--
Juan Marcos Mirande
Fundación Miguel Lillo - CONICET
Miguel Lillo 251
(4000) San Miguel de Tucumán
Argentina



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Vie, 3 de Abr, 2009 3:39 pm

pachulon
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Hola, estoy corriendo una matriz de 290 x 1100 en Mr Bayes y no puedo llegar al punto optimo (0.01). Despues de correr 10.000.000 de generaciones llegoa 0.05,...
Samuel Miÿfffff1o
pachulon
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3 de Abr, 2009
3:40 pm

Podes ver de cambiar el Nset que varia con el modelo al cual se ajustan tus datos (el modeltest-paup te lo selecciona, asi podes decirle al programa si es GTR...
regonzalez@...
raulgenetista
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3 de Abr, 2009
3:57 pm

jaja, estuve a punto de contestar que en este foro era difícil que consiga una respuesta... saludos a todos Marcos. ... -- Juan Marcos Mirande Fundación...
Marcos Mirande
mcmirande
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3 de Abr, 2009
4:05 pm

Me hizo acordar la charla de Pablo en la reunión de Córdoba... jeje Salut!...
Marcos
acrididae
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3 de Abr, 2009
7:08 pm

ok. voy a probar con eso. De todas formas con los datos del model test le cargo un modelo personalizado con todos los parámetros. Porque el modelo es TVM y no...
Samuel Miÿfffff1o
pachulon
Sin conexión Enviar correo
3 de Abr, 2009
4:27 pm
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