Hola Alejandro

Tanto en PAUP como en TNT los no aplicables se tratan de la misma
manera que los desconocidos: como desconocidos, es decir, que no
influyen en el calculo final de la longitud del árbol: donde quiera
que estén en la topología el árbol mide igual...

La consecuencia de eso, es que muchos caracteres desconocidos (bien
sean no aplicables, o que no se pudieron examinar), puede aumentar la
ambigüedad.

La notación de "-" o "?" es más una ayuda visual para el que revisa la matriz!

El paper de DeLaet (2005) en el libro editado por Alberts
(Phylogenetics, Parsimony and genomics, o algo así) es un excelente
paper sobre inaplicables y su codificación,

Saludos
Salvador


2009/6/12 alejandro valerio <avalerio_13@...>:
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> Hola, yo tengo la siguiente pregunta para Uds a ver ni me aclaran una duda
> que tengo
> Hasta donde yo se en PAUP cuando se utiliza el símbolo "-" en una matriz
> morfologica dada para determinar en ella la situacion de que el caracter
> usando no aplicable para un taxon dado al final de cuentas lo asume como "?"
> y asi lo equipara como  caracter ausente paar efectos del analisis ... estoy
> en lo correcto o me la estoy pelado?
> Ademas, yo quisiera saber si en TNT hay algo paracesido para efectos de
> codificasion de ausente y no aplicable??
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> Alejandro Valerio
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J. Salvador Arias
Becario CONICET
INSUE, Instituto Miguel Lillo, Miguel Lillo 205
4000 San Miguel de Tucumán, Argentina