HOla
Alguien tendría en pdf, los resúmenes de la última reunión de
cladística?

Saludos a todos,

Si alguien tiene los siguientes articulos en pdf, sera
posible que se puedan subir al blog del grupo?

Swofford, D. L., and W. P. Maddison. 1992. Parsimony,
character-state reconstructions, and evolutionary
inferences. Pages 187 – 223. In R. L. Mayden (ed.),
Systematics, Historical Ecology, and North American
Freshwater Fishes.

WENZEL, J. W. AND J. M. CARPENTER. 1994. Comparing
methods: adaptive traits and tests of adaptation. In:
P. Eggleton and R. Vane-Wright (eds)Phylogenetics and
Ecology. Academic Press, London,  pp. 79-101.

Muchisimas gracias

Julian



Julián Andrés Velasco

Grupo de Investigacion en Ecología Animal Aplicada
Departamento de Biologia
Universidad del Valle
Cali-Colombia
juvelas@...





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Estoy iniciandome en temas cladisticos y mi consulta es la siguiente:
siempre se trata de trabajar con grupos monofiléticos o comprobar la
monofilia de un grupo.
Que ocurre si quiero trabajar sobre un grupo monofilético de varias
especies con distribución mundial, pero solamente quiero tomar las
taxones de un área determinada (por ejemplo, Europa, América del Sur,
etc) ya que tomar todas las especies serian muchas.
Mi consulta es: es válido este estudio? Tiene sentido comprobar la
monofilia de esas especies que ocupan esa área?.
Les agradecería la respuesta!

Miembro de Clado
clado@...
Argentina

BUTTERFLY WATCHING IN TROPICAL DRY FOREST

Interested in watching butterflies in tropical dry forest, Domitila Lodge is
offering you a good opportunity.
Check dates and more information in :
www.bio-nica.info/Domitila.htm

<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<

SEJOUR ENTOMOLOGIQUE - OBSERVATION DE PAPILLONS - EN FORET TROPICALE SECHE

Si vous aimez l'observation de papillons, la forêt tropicale seche et
particulièrement le Domaine de Domitila vous en donne la possibilité. Voyez les
dates et un complément d'informations sur :
www.bio-nica.info/Domitila.htm

<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<

MARIPOSAS DEL BOSQUE DE TROPICO SECO

Le interesan las mariposas o el bosque tropical seco, la Reserva Silvestre
privada de Domitila le ofrece la posibilidad de experimentar este tipo de
ecosistema en via de desaparición.
Vean las fechas y más informaciones en:
www.bio-nica.info/Domitila.htm

<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<


Friendly,
Amicalement,
Con amistad,

Jean-Michel.


Dr. Jean-Michel MAES
MUSEO ENTOMOLOGICO
AP 527
LEON
NICARAGUA
tel 505-3116586
FAX 505-3110126
jmmaes@...
jmmaes@...
jmmaes@...
jmmaes@...
afleon@... (oficina de la Alianza Francesa)

www.bio-nica.org (main page in spanish)
http://www.ibw.com.ni/u/jmmaes (pequeña pagina de contacto)
http://espanol.groups.yahoo.com/group/MEL-Info/ (lista de anuncios - puede
inscribirse si le parece)
www.avesnicaragua.org (aves)
http://www.insectariumvirtual.com/termitero/nicaragua/welcome.htm (Insectos)
http://www.coleoptera.org/p1760.htm (Lucanidae genera)

---------------------------------------------------

Postdoctoral Position

Systematics and Phylogeny of Organisms

Department of Biological Sciences
George Washington University Office: 202 994 7144
Lisner Hall #340 Fax #    202 994 6100
Washington, DC    20052 email jclark@...


Applications are invited for a postdoctoral position in the Department of Biological Sciences at the George Washington
University in Washington DC.  The successful candidate will be doing empirical investigations of the systematics and phylogeny
of organisms. The applicant must have experience with phylogenetic analyses of large data sets (i.e., more than 30 taxa), and
will assist in organizing a series of workshops on large data sets in phylogenetic reconstruction.


A completed PhD and experience in systematics and phylogeny is required.  A background in an area of research related to
those of a current faculty member in the department and an interest in computational methods is helpful but not required. 
Salary starts at $40,000 include benefits with merit increases scheduled yearly.  Start date is September 1 2008 with funding
for 2 Years.  Applicants should submit a CV including a list of publications, a description of technological expertise (including
computer based analyses) and a list of colleagues/mentors including phone and email who have agreed to serve as a reference.

Applications can be submitted either by email or regular mail and will be accepted until the position is filled.

Please email application materials to jclark@...

Eduardo,

hola, qué tal?

te escribo porque estoy por dictar el curso de cladística. Recuerdo que
habíamos quedado en que te iba a hacer aparecer como alumno (en vista de que
en Colombia no te dieron ningun certificado). Cómo hacemos? Simplemente te
incluyo en la lista de aprobados al final del curso? Si así fuera, por las
dudas, recordamelo a fines de setiembre.

O hay que hacer algo más?

---------------------------------------------------
Pablo A. Goloboff
INSUE, CONICET, Instituto Miguel Lillo,
Miguel Lillo 205 - 4000 S.M.Tucuman - Argentina
Phone/FAX (+54381)-4232965

Hola Pablo, creo que me mandaste el mensaje de otro
Colombiano, yo soy Juan el estudiante de Virginia. Yo
quería ir al curso pero no pude conseguir fondos esta
vez. Hablamos.

Juan


--- Pablo Goloboff <pablogolo@...> wrote:

> Eduardo,
>
> hola, qué tal?
>
> te escribo porque estoy por dictar el curso de
> cladística.  Recuerdo que
> habíamos quedado en que te iba a hacer aparecer como
> alumno (en vista de que
> en Colombia no te dieron ningun certificado).  Cómo
> hacemos?  Simplemente te
> incluyo en la lista de aprobados al final del curso?
>  Si así fuera, por las
> dudas, recordamelo a fines de setiembre.
>
> O hay que hacer algo más?
>
> ---------------------------------------------------
> Pablo A. Goloboff
> INSUE, CONICET, Instituto Miguel Lillo,
> Miguel Lillo 205 - 4000 S.M.Tucuman - Argentina
> Phone/FAX (+54381)-4232965
>
>


Juan D. Daza
University of Puerto Rico
Biology Department
PO Box 23360
San Juan, PR. 00931-3360



________________________________________________________________________________\
____
Got a little couch potato?
Check out fun summer activities for kids.
http://search.yahoo.com/search?fr=oni_on_mail&p=summer+activities+for+kids&cs=bz

Estimada gente de clado,

Perdón, perdón!!

acabo de mandar un mensaje (dirigido a "Eduardo") por error a la lista.
Disculpen, e ignorenló.

---------------------------------------------------
Pablo A. Goloboff
INSUE, CONICET, Instituto Miguel Lillo,
Miguel Lillo 205 - 4000 S.M.Tucuman - Argentina
Phone/FAX (+54381)-4232965

Eduardo,

hola, qué tal?

te escribo porque estoy por dictar el curso de cladística.  Recuerdo que
habíamos quedado en que te iba a hacer aparecer como alumno (en vista de que
en Colombia no te dieron ningun certificado).  Cómo hacemos?  Simplemente te
incluyo en la lista de aprobados al final del curso?  Si así fuera, por las
dudas, recordamelo a fines de setiembre.

O hay que hacer algo más?

---------------------------------------------------
Pablo A. Goloboff
INSUE, CONICET, Instituto Miguel Lillo,
Miguel Lillo 205 - 4000 S.M.Tucuman - Argentina
Phone/FAX (+54381)-4232965

Hola Sergio,

Saludos al grupo Clado!!!!!

Hace tiempo yo tenia la misma duda que tu... y se las participe a
Claudia. Ella me pidio que le enviara un ejemplo de archivo, por
ejemplo shapefile de ArcView (*.shp, *.dbf, etc) para ver si ellos
lo programaban en otras versiones de NDM. El problema es que no se
lo he enviado... soy un carrero (como decimos en Vzla!!!)

Por otro lado, estoy haciendo lo siguiente con las salidas de NDM:

Guardo cada imagen de Windows Metafile y las paso a TIFF o JPEG,
luego la georeferencio para convertirlas en mapas, finalmente las
llevo a cualquier programa: ArcView, Qgis, Diva-GIS, etc.

Todo esto es debido al problema que he tenido con Global Mapper: La
version gratis solo puede mostrar los archivos y no se pueden
exportar a otros formatos (aparentemente esta deshabilitada esta
opcion en el DEMO)

Creo que los usuarios de NDM debemos ver que otro formato puede ser
interesante para las salidas de las areas de endemismo. Para asi
proponerlas a Pablo y Claudia.

Saludos, y nos vemos en San Isidro. Ya mande mi trabajo de Areas de
endemismo en Haemagogus (Dipt.: Culicidae)







--- En clado@..., "Lone Aagesen" <laagesen@...>
escribió:
>
> Hola Sergio,
>
> Claudia y Pablo agregaron el output en formato acf a mi pedido
para usar en Global Mapper.
>
> Global Mapper tiene una versión gratis que se puede bajar desde el
internet.
>
> Es el programa recomendado por nasa desde la pagina donde se puede
bajar los imagines satelitales de Landsat. Ahí también hay todo la
información como usar el programa.
>
>
>
> Eso fue hace mucho (antes el tiempo de Google Earth).
>
> Nosotros hemos exportado información desde Global Mapper a Diva
Gis - pero tienes que exportar cada capa (una jpg del área y otra
capa con los puntos que definen el área).
>
>
>
> Creo que lo ideal hoy día seria tener un output de ndm que se
puede leer con Google Earth directamente.
>
>
> saludos Lone
>
>   ----- Original Message -----
>   From: sergio bolivar leguizamon
>   To: clado@...
>   Sent: Saturday, August 04, 2007 5:26 PM
>   Subject: SNIMTA_SPAM [clado] hola a todos...
>
>
>   Utilizo NDM y quisiera saber que programa GIS lee los archivos
de salida en ACF...
>   he intentado con Diva-gis y otros programas y no los recibe..
>   cual programa los puede leer...
>
>   gracias...
>
>
>
>   Sergio David Bolvar Leguizamn
>   Ungraduate Student
>   Escuela de Biologa
>   Facultad de Ciencias
>   Universidad Industrial de Santander
>   Colombia-Sudamrica
>   sergiobolivar@...
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>

----- Original Message -----

From: sergio bolivar leguizamon

To: clado@...

Sent: Saturday, August 04, 2007 5:26 PM

Subject: SNIMTA_SPAM [clado] hola a todos...

Utilizo NDM y quisiera saber que programa GIS lee los archivos de salida en ACF...
he intentado con Diva-gis y otros programas y no los recibe..
cual programa los puede leer...

gracias...



Sergio David Bolvar Leguizamn
Ungraduate Student
Escuela de Biologa
Facultad de Ciencias
Universidad Industrial de Santander
Colombia-Sudamrica
sergiobolivar@tux.uis.edu.co
bolivaruis@gmail.com

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favor divulgar para outros interessados....

CURSO DE ACTUALIZACION TAXONÓMICA EN ESCARABAJOS (SCARABAEOIDEA) CON
ÉNFASIS EN ESCARABAJOS COPRÓFAGOS Y OTROS LAPAROSTICTI

10 al 16 de diciembre de 2007
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Villa de Leyva, Boyacá, Colombia

PROFESOR: Dr. FERNANDO VAZ-DE-MELLO
Universidade Federal de Lavras, Brasil


El Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von
Humboldt y la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia
U.P.T.C., organizan el "Curso de actualización taxonómica en
escarabajos (Scarabaeoidea)", orientado por el Dr. Fernando
Vaz-de–Mello, investigador asociado a la Universidade Federal de
Lavras de Brasil, que se llevará a cabo del 10 al 16 de diciembre del
presente año, en la cuidad de Villa de Leyva, Colombia.

El curso tiene como objetivos actualizar a los estudiantes en las
nuevas propuestas de clasificación de los escarabajos (Scarabaeoidea)
con énfasis en coprófagos, identificación de los principales grupos,
manejo de claves y métodos de campo.

Público objetivo: estudiantes de últimos semestres de licenciatura
(pregrado) o posgrado en biología o carreras afines e investigadores
en el área, con conocimientos mínimos de morfología de insectos e
intereses particulares en la taxonomía y sistemática de los
Scarabaeoidea, con énfasis en escarabajos  coprófagos.
Número de cupos: 30
Forma de inscripción: los aspirantes deberán presentar los siguientes
documentos en formato escrito o digital:
• Hoja de vida resumida (máximo 2 páginas), indicando profesión,
ocupación actual y detalles de contacto.
• Una carta de intención del participante donde explique su interés en
tomar el curso y la manera como involucrará los conocimientos
adquiridos en su proyecto profesional.
• Dos (2) referencias de dos personas con las que halla trabajado el
aspirante en el ámbito académico o profesional.
Los documentos deben ser enviados a nombre de Mónica Ospina a la dirección:
Instituto Alexander von Humboldt
Calle 28A No. 15-09, Bogotá, Colombia.
O a la siguiente dirección electrónica:
Mónica Ospina: monikaospina@... con copia a
mospina@... y fredymol@...
Contacto: Mónica Ospina: monikaospina@...; mospina@...
Fredy Molano: fredymol@...

Lugar: Instituto de Investigación de recursos Biológicos Alexander von
Humboldt, Claustro de San Agustín, Villa de Leyva, Boyacá, Colombia.

Programa

1. Visión general sobre Scarabaeoidea
1.1. Identificación de familias/subfamilias

2. Visión general sobre los Laparosticti
2.1. Problemas taxonómicos de los Laparosticti
2.2. Grupos neotropicales de Laparosticti

3. Ochodaeidae
3.1. Visión general
3.2. Identificación

4. Allidiostomatidae
4.1. Visión general
4.2. Identificación

5. Glaresidae
5.1. Visión general
5.2. Identificación

6. Trogidae
6.1. Visión general
6.2. Identificación

7.      Orphnidae
7.1.    visión general
7.2.    identificación

8. Phaenognathidae/Aclopidae
8.1. Visión general
8.2. Identificación

9. Geotrupidae/Bolboceratidae
9.1. Visión general
9.2. Identificación de grupos – Geotrupinae – Taurocerastinae –
Bolboceratinae - Athyreinae
9.3. Geotrupinae y Taurocerastinae
9.3.1. Identificación
9.4. Bolboceratinae y Athyreinae
9.4.1. Identificación

10. Hybosoridae
10.1. Visión general
10.2. Identificación de grupos – Anaidinae, Hybosorinae –
Ceratocanthinae – inciertos
10.3. Anaidinae, Hybosorinae y inciertos
10.3.1.Identificación
10.4. Ceratocanthinae
10.4.1.Identificación

11.     Aegialiidae
11.1.   visión general
11.2.   identificación

12.     Scarabaeidae - Aphodiinae y grupos afines
12.1.   visión general
12.2.   identificación de grupos: Aphodiinae – Eupariinae – Psammodiinae
– Rhyparinae
12.3.   Aphodiinae
12.3.1. identificación
12.4.   Eupariinae
12.4.1. identificación
12.5 .   Psammodiinae
12.5.1. identificación
12.6.   Rhyparinae
12.6.1. identificación

13.     Scarabaeidae-Scarabaeinae
13.1.   visión general
13.2.   identificación de grupos: Coprini, Oniticellini, Onitini,
Phanaeini, Canthonini, Sisyphini, Eucraniini, Onthophagini, Ateuchini,
Eurysternini
13.3.   Oniticellini – Sisyphini - Onitini
13.3.1. identificación
13.4.   Phanaeini - Eucraniini
13.4.1. identificación
13.5.   Onthophagini - Eurysternini
13.5.1. identificación
13.6 .   Canthonini
13.6.1. identificación
13.7.   Coprini
13.7.1. identificación
13.8.   Ateuchini
13.8.1. identificación


--
Fernando Z. Vaz-de-Mello
Instituto de Ecología, A.C.
Departamento de Biodiversidad y Ecología Animal
Km 2.5 Carretera Antigua a Coatepec, 351
Congregación El Haya
91070 Xalapa, Veracruz
MEXICO

Tel. (+52) (228) 842 18 00 #4111
Fax (+52) (228) 842 18 00 #4102

http://www-museum.unl.edu/research/entomology/workers/FVazdeMello.htm
publications:
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.jsp?id=K4767878J5#Producaoc\
ientifica
vazdemello@...

Hola,

Este mensaje sirve para notificarle que se ha cargado
un archivo a la sección Archivos del grupo clado.

Archivo : /2ª circular.doc
Responsable : amaliascataglini <amaliascataglini@yahoo.com.ar>
Descripción : 2º circular VII Reunión de Cladística y Biogeografía

Puede acceder al archivo en la dirección

http://ar.groups.yahoo.com/group/clado/files/2%80%A0%A6%AA%20circular.doc

Para más información acerca de cómo compartir archivos con su grupo,
consulte nuestra sección de ayuda en

http://help.yahoo.com/help/ar/groups/files

Atentamente,

amaliascataglini <amaliascataglini@yahoo.com.ar>

De: Martín Badell <tinch84@...>
Para: lchorno@...
Asunto: FW: 2 BECAS AGENCIA DE INVESTIGACION: POLEN - ARQUEOFAUNA
Fecha: Tue, 17 Jul 2007 22:13:18 +0000




>From: "Gradcom"
>To:
>Subject: 2 BECAS AGENCIA DE INVESTIGACION: POLEN - ARQUEOFAUNA
>Date: Mon, 16 Jul 2007 20:03:14 -0300
>
>Estimados: les reenviamos la siguiente convocatoria para cubrir becas que
>hemos recibido en la carrera.
>
>Atentamente
>Dirección de la Carrera
>
>--------------------------------------------------------------------------------
>
>
>
>
>
>El proyecto CIRCULACIÓN HUMANA Y USO DEL LITORAL MARÍTIMO NORPATAGÓNICO A
>PARTIR DEL HOLOCENO MEDIO (PICT 2005 Nº38264) llama a concurso para cubrir
>DOS (2) BECAS DE INVESTIGACION DE NIVEL INICIAL.
>
>Las becas son de dedicación exclusiva (40 horas semanales) y tienen una
>duración de 30 meses. El estipendio mensual es de $1.516, según los valores
>fijados por la ANPCyT.
>
>
>
>El lugar de trabajo de los becarios será el INCUAPA, Departamento de
>Arqueología, Facultad de Ciencias Sociales, UNCPBA, Olavarría (Pcia. de Bs.
>As.).
>
>INICIO: 1 de septiembre de 2007
>
>
>
>Tema de la Beca 1 - PALINOLOGIA
>
>Evaluación de los cambios ecológico-ambientales que se sucedieron en la
>costa rionegrina desde el Holoceno medio mediante estudios palinológicos.
>
>Es una beca interdisciplinaria orientada a la reconstrucción del entorno
>ambiental de las poblaciones humanas del pasado. Como parte de este estudio
>se explorará la eventual expresión en el litoral norpatagónico de
>fluctuaciones climáticas referibles al Período Cálido Medieval (siglos X al
>XII aprox.) detectadas en otras áreas de Patagonia. Se trabajará con
>muestras correspondientes a depósitos eólicos y lacustres ubicados en las
>costas norte y oeste del golfo San Matías (Río Negro).
>
>
>
>Posibilidad de pasantía de entrenamiento de laboratorio en Mar del Plata.
>
>Director: Dr. Cristian M. Favier Dubois, codirección a cargo de un
>especialista en palinología.
>
>
>
>Requisitos
>Ser graduado en Cs. Biológicas, Geológicas, Antropológicas o afines, de
>cualquier Universidad del país. Hasta 35 años de edad. Compromiso de
>inscripción a un Doctorado acreditado por la CONEAU dentro de los seis
>meses de inicio de la beca. No haber sido beneficiarios de becas de
>postgrado por un período de cuatro años o mayor. Presentar una nota de
>solicitud de la Beca y un Curriculum Vitae actualizado a
>cfavier@... (dirigirse también a este mail por consultas)
>
>Fecha límite de la presentación: 16 de agosto de 2007
>
>
>
>
>
>
>Tema de la Beca 2 - ARQUEOFAUNA
>
>Aprovechamiento de los recursos faunísticos en las ocupaciones humanas de
>la costa rionegrina en el Holoceno medio y tardío.
>
>Beca orientada específicamente al análisis arqueofaunístico de vertebrados
>terrestres considerando aspectos taxonómicos y formacionales que permitan
>evaluar la integridad de los conjuntos para discutir el uso del espacio
>costero a lo largo del tiempo (subsistencia y tecnología).
>
>
>
>Directora: Dra. Florencia Borella.
>
>
>
>Requisitos
>Ser graduado en Ciencias Antropológicas (con formación en Arqueología) o en
>Ciencias Biológicas, de cualquier Universidad del país. Tener hasta 35 años
>de edad. Compromiso de inscripción a un Doctorado acreditado por la CONEAU
>dentro de los seis meses de inicio de la beca. No haber sido beneficiarios
>de becas de postgrado por un período de cuatro años o mayor. Presentar una
>nota de solicitud de la Beca y un Curriculum Vitae actualizado a
>fborella@... (dirigirse también a este mail por consultas).
>
>Fecha límite de la presentación: 16 de agosto de 2007
>
>
>Por cualquier información respecto a normativas de la ANPCyT consultar a:
>www.agencia.gov.ar/foncyt Bolsa Becas.
>
>
>
>
>
>
>
>Secretaría de Extensión. Bienestar y Transferencia
>
>Facultad de Ciencias Sociales UNICEN
>
>Complejo Univeristario de Olavarría
>
>(02284) 450115
>
>contacto: comunica@...
>
>
>
>
>
>
>
>--------------------------------------------------------------------------------
>
>
>No virus found in this incoming message.
>Checked by AVG Free Edition.
>Version: 7.5.476 / Virus Database: 269.10.6/902 - Release Date: 15/07/2007
>14:21

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Hola,

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   Archivo     : /2ª circular.doc
   Responsable : amaliascataglini <amaliascataglini@...>
   Descripción : 2º circular VII Reunión de Cladística y Biogeografía

Puede acceder al archivo en la dirección

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consulte nuestra sección de ayuda en

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Atentamente,

amaliascataglini <amaliascataglini@...>

----- Original Message -----
From: Investigadores FSOC
To: Lista Investigadores
Sent: Monday, July 16, 2007 11:18 AM
Subject: UBATEC-Ayuda económica para la presentación de trabajos en Congresos Nacionales e Internacionales que se realicen en el país

De nuestra mayor consideración:


Nos dirigimos a Usted con el objeto de comunicarle que se encuentra abierto el llamado a concurso para el otorgamiento de “AYUDA ECONÓMICA PARA LA PRESENTACIÓN DE TRABAJOS EN CONGRESOS NACIONALES E INTERNACIONALES QUE SE REALICEN EN EL PAIS” para becarios de posgrado y/o docentes auxiliares  de la Universidad de Buenos Aires, que será gestionado por UBATEC S.A.


Las solicitudes de Ayuda Económica abarcarán el período comprendido entre el 1º de Junio de 2007 al 31 de Diciembre de 2007 y serán recepcionadas en el Departamento de Becas, Reconquista 694 2º piso oficina 207 en el horario de 10 a 18 horas. La persona responsable de la recepción será la Dra. María Laura Lastres a quien se podrá consultar por medio del correo electrónico mllastres@... o el teléfono 4510-1216/1217 en el horario de 11 a 18 horas.


El plazo para la entrega de las presentaciones se extiende del 16 de julio al 16 de agosto de 2007.


A efectos de lograr un conocimiento acabado de la convocatoria, adjuntamos la Resolución (CS) Nº 2282/07  en cuyo anexo se encuentran las “Bases del llamado para el otorgamiento de Ayuda Económica".

 
Sin otro particular y solicitándole dar la mayor difusión de la presente, lo saludamos muy atentamente.
 
 
 
 
Lista Investigadores
Secretaría de Investigación
Facultad de Ciencias Sociales
Universidad de Buenos Aires

Scientific Data Curator

• PhenoMap
• Mabee et al. (2007) Phenotype ontologies: the bridge between genomics and evolution. Trends Ecol Evol. doi:10.1016/j.tree.2007.03.013

• Ph.D. degree in biological sciences with expertise in comparative vertebrate anatomy and evolution

• Ph.D. degree in biological sciences with expert knowledge of comparative anatomy and evolution of fishes
• Ability to communicate well and work as part of a distributed research team
• Experience using or creating ontologies

Hola Peterson y Martín,

Si la forma de codificar que propone Peterson implica que cada bicho sin
cola tiene un estado único de un carácter no-aditivo, Martín está en lo
cierto: cualquier estado de un carácter no-aditivo que ocurre en un solo
taxón puede ser reemplazado por una entrada faltante sin que varíen los
resultados.

El problema con considerar al carácter como no-aditivo es que si tenemos (en
ausencia de toda otra información) varios bichos con cola de distinto color
metidos dentro de un grupo más grande de bichos sin cola, los árboles que
separan a los bichos con colas de diferentes colores en distintos grupos (de
forma que la cola se "origina" varias veces) tendrán exactamente el mismo
score que los árboles donde los bichos que tienen cola forman un grupo
monofilético.  Y eso es claramente algo que no queremos.  Maddison había
considerado la posibilidad de usar caracteres no-aditivos y lo descarta
justamente por eso.  No queda más vuelta que usar caracteres de sankoff
donde los costos sean tales que sea preferible agrupar los bichos con cola;
es decir

                 sin cola --> cola roja :  2 pasos
                 sin cola --> cola azul :  2 pasos

y todas las demás transformaciones de costo 1. Esto crea el problema de que
la ganancia de cola (2 pasos) puede ganarle a cualquier otro carácter común
(que cueste un solo paso), pero al menos sabemos que nos dará las
optimizaciones correctas para el carácter en cuestión.  Y si tenemos muchas
alternativas (cola roja o azul o verde, con escamas o lisa o con carenas,
ancha o finita, con cresta o sin cresta) se nos multiplica rápidamente el
número de estados que tenemos que darle al caracter de sankoff y nos pasamos
del número de estados que los programas nos permiten analizar...

Jan De Laet está trabajando en esto (ha retomado sus investigaciones sobre
caracteres inaplicables).  No sé si la solución que tiene es totalmente
satisfactoria.  De lo que estoy seguro es de que es muy difícil resolver el
problema totalmente con pequeños parches a los algoritmos convencionales.

---------------------------------------------------
Pablo A. Goloboff
INSUE, CONICET, Instituto Miguel Lillo,
Miguel Lillo 205 - 4000 S.M.Tucuman - Argentina
Phone/FAX (+54381)-4232965

   Hi there, Pablo! Thanks for the prompt reply! Hope ever'thing is fine with you.

   Yes, that is the point. The character is discrete, non-additive...
   The whole thing has to do with missing data, as a matter of fact. Instead of coding "?" for the color of tail of a tailless lizard (what would end up joining it with either the red-tailed or the blue-tailed), one could just code a unique state for it, what would set that taxon apart for that character. Now imagine one has more than 32 tailless lizards... There is where my problem lies!
    Well, if I come up with something, or even if one (even myself) finds this useless...
      
     Best wishes!!
 

----- Mensagem original ----
De: "pablogolo@..." <pablogolo@...>
Para: clado@...
Enviadas: Sexta-feira, 29 de Junho de 2007 18:50:53
Assunto: Re: [clado] Increasing number of character states in TNT


Hola Peterson,

no, si el carácter no es aditivo (o lo que es lo mismo, continuo), no hay
manera de tener más de 32 estados. Cada estado es un bit, y TNT es (por
ahora al menos) un programa de 32-bits.

Vas a tener que buscar alguna alternativa. ..

--Pablo Goloboff




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